cytoscape软件安装与使用-绘制蛋白互作网络图
cytoscape绘制蛋白互作网络图
1.cytoscape软件安装
1.java JDK安装，建议jdk 8，安装方法：https://www.omicsclass.com/article/298
2.cytoscape软件下载安装，必须上一步java jdk安装完成之后才可以安装cytoscape软件，因为cytoscape软件为java软件。https://cytoscape.org/
2.基本使用，网络图绘制，分析等等
2.1 网络导入
导入网络数据，为txt文件两列数据就可以，如果是蛋白互作网络关系，可以从STRING数据库得到：https://www.omicsclass.com/article/1126
文件准备好之后可以导入网络了，方法：
设置网络的，节点信息：
然后就可以得到网络图了:
2.2 网络图修改美化
上面的网络图比较丑，可以做一些修改美化，比如，点的型状颜色，线的颜色等等设置；
整体设置：
更多网络图绘制，展示，编辑，分析技巧见：cytoscape与网络图绘制课程
- 发表于 2019-12-02 16:26
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- 分类：软件工具
