ggalluvial 展示ceRNA调控关系
ggalluvial 展示ceRNA调控关系
为了更好地了解lncRNAs与HCC中miRNA结合介导的mRNAs的影响，作者基于上述数据构建了一个ceRNA网络，并使用ggalluvial R软件包来显示网络。作者基于miRDB，miRTarBase和TargetScan数据库综合分析，最后使用26个DElncRNA，4个DEmiRNA和6个DEmRNA来建立ceRNA网络。此外，作者计算了每个基因的拓扑系数以说明其在ceRNA网络中的重要性。HCC中ceRNA网络的Sankey图如图二所示，其中每个矩形代表一个基因，并且基于矩形的大小可视化每个基因的连接程度。
参考文献
Construction and comprehensive analysis of a ceRNA network to reveal potential prognostic biomarkers for hepatocellular carcinoma.
- 发表于 2020-01-08 18:14
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