利用Python matplotlib库对基因组同源区域和进化速率进行可视化展示!!!

利用Python matplotlib库对基因组同源区域和进化速率进行可视化展示!!!

相关软件:ColinearScan、Python、BioPerl、BLAST

分析流程:

1、下载人类、猕猴、树鼩(参考物种)基因组数据,利用Python语言对基因组数据进行处理。

2、利用BLAST进行序列比对,或者基因组之间的同源信息。

3、利用强大的ColinearScan共线性分析软件获取共线性区段。

4、利用Bioperl计算Ka/Ks值。

5、利用Python强大的第三方库matplotlib 进行可视化展示。

(华北理工大学生命科学学院生物信息学-李高杰)

  • 发表于 2020-03-12 13:06
  • 阅读 ( 3313 )
  • 分类:遗传进化

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