在线绘制基因染色体位置图
在线绘制基因染色体位置图
之前我们在 绘制基因染色体位置图 这篇文章里介绍了Mapchart软件绘制基因染色体位置图。今天再介绍一个可以绘制染色体位置图的在线网站——MapGene2Chrom。
网站地址：http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.1/。
输入文件准备
绘制染色体位置图需要准备两个文件：基因位置文件和染色体长度文件。基因位置文件格式如下：
AT1G06180.1 1889408 1891158 Chr1
AT1G08810.1 2819065 2820395 Chr1
AT1G08810.2 2819068 2820020 Chr1
AT1G09540.1 3086159 3087912 Chr1 blue
AT1G09770.1 3161841 3165360 Chr1 red
第一列为基因ID；第二列为基因起始位置；第三列为基因终止位置；第四列为；基因所属染色体名称；第五列为设置基因的颜色。
染色体长度文件格式如下：
Chr1 30427671
Chr2 19698289
Chr3 23459830
Chr4 18585056
Chr5 26975502
第一列为染色体名称；第二列为染色体长度。
绘图
准备好输入文件后即可打开MapGene2Chrom网站绘制图片了。将基因位置信息和染色体长度信息分别输入对应的文本框中，点击 “DRAW” 绘图，生成图片如下。
网站左侧还可以设置一些参数，对图片进行修改：
如设置染色体名称的字体、大小和颜色，染色体的宽高以及颜色，基因名称的字体大小及显示方式等。大家可以试着设置一下，绘制自己需要的图片，小编这里就不细讲了。
绘制好图片后即可下载需要的图片格式。
好了，今天就到这里，大家操作一下试试吧，下期再见！
此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下：
1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程
2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读
3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章档次，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析
4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘
6. 更多学习内容：linux、perl、R语言画图，更多免费课程请点击以下链接：
- 发表于 2021-11-12 15:30
- 阅读 ( 7591 )
- 分类：软件工具
