qiime2 安装Linux中安装,采用conda安装,下载qiime2官方的yml文件:
wget https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2022.8-py38-linux-conda.yml conda env create -n qiime2-2022.8 --file qiime2-2022.8-py38-linux-conda.yml
注意这里的文件需要修改一下,镜像源修改为国内的清华镜像,其他不变:
channels:
# - qiime2/label/r2022.8
# - https://packages.qiime2.org/qiime2/2022.8/passed/core/
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/qiime2
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
- defaults
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