pyvcf的安装

python的pyvcf模块是许多软件的依赖,如cuteSV等,可是直接安装会报错这里可以看出来,pyvcf的安装包竟然还在使用python2编写,因此为了使用它,需要用到use_2to3这个小模块,毫无疑问,这也是...

python的pyvcf模块是许多软件的依赖,如cuteSV等,可是直接安装会报错

attachments-2023-04-37dATTap643cf0dd233a1.png这里可以看出来,pyvcf的安装包竟然还在使用python2编写,因此为了使用它,需要用到use_2to3这个小模块,毫无疑问,这也是一个相当老的模块,因此无法在最新版的setuptools上使用,
因此我们可以先将setuptoos降级到58.0以下,比如

pip3 install setuptools==57.5.0

然后再安装pyvcf软件

pip3 install PyVCF

attachments-2023-04-ohKv1n19643cf2d2a7610.png成功安装

当然,如果需要再将setuptoos更新回去也很方便

pip install --upgrade setuptools
  • 发表于 2023-04-17 15:21
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