NCBI 下载病毒基因组的gff3

NCBI (National Center for Biotechnology Information),是我们经常使用的数据库,其本身在数据以外也为我们提供了很多好用的小工具。病毒的基因组比较小,通常不会像大型基因组那样释放的时候...

NCBI (National Center for Biotechnology Information),是我们经常使用的数据库,其本身在数据以外也为我们提供了很多好用的小工具。病毒的基因组比较小,通常不会像大型基因组那样释放的时候带有gff3和gtf文件,此时如果我们想获得病毒的gff可以在send to中选择保存文件的格式:

attachments-2023-09-vK1krblh65011c4d3958a.png


通过这个方式保存的gff格式如下:

attachments-2023-09-fV5uBND165011caf42a5a.png


其中第三列feature并不符合许多软件识别的格式,可以自行进行修改。


  • 发表于 2023-09-13 10:23
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