使用R包(VennDiagram)进行韦恩图绘制时相关参数调整

介绍一些VennDiagram常用的绘图参数

VennDiagram是绘制韦恩图时较为常用的一个R包,通过对其中的相关参数进行调整可以达到不同的个性化效果,今天我给大家介绍一些常用的绘图参数:

###
venn.plot <- venn.diagram(
gene_list,#输入的基因数据
scaled = FALSE,#不根据数据的大小来自动调节圆的大小
fill = c(“green”, “yellow”), # 区域填充色(以两组数据为例,下同)
filename = NULL, #指定不输出到屏幕
lwd = 2,#圆形边的宽度
alpha = 0.75,#着色透明度
cex = 2,#区域内部数字的大小
cat.cex = 2,#类名称(区域的label)字体大小
cat.col = c("cornflowerblue", "darkorchid1"),#类名称颜色
cat.pos = c(-15, -10),#以12点方向为起点,类名称绕圆心顺时针转动的角度
cat.dist = c(0.03, 0.03),#类名称距圆心的距离
ext.text = F,#当区域的数目太时,会自动使用引导线注释,可以通过F取消
ext.percent = 0 #或者自行决定阈值)
grid.draw(venn.plot);
dev.off()
###

绘图效果如下:

attachments-2023-09-cLvt9hQy6501227c20e8a.png

  • 发表于 2023-09-13 10:48
  • 阅读 ( 2558 )
  • 分类:R

0 条评论

请先 登录 后评论
每天学习一点点
每天学习一点点

53 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 702 文章
  2. 安生水 350 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. xun 82 文章
  6. rzx 78 文章
  7. 红橙子 78 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章