数据分析代码2__用法

代码介绍

这个代码有两个主模块,DataFetcher and CountSummarizer

前者使用cr调用,用于从根据参考列提取数据,
attachments-2023-10-Eci9cknV6540c462ab7e2.png

比如有一个文件
attachments-2023-10-Fjs7T0u36540c4b43a4ea.png想根据这里的某一列提取行,参考数据如下
attachments-2023-10-3GLiK1fe6540c50d9175f.png

使用代码,得到结果
attachments-2023-10-wI35D1o16540c589ae986.png


后者使用ex调用,功能复杂一点,用法比较多不一一距离,常用于丰度估计

attachments-2023-10-nQMW1gjy6540c6010cbd2.png

比如一个物种分类表attachments-2023-10-TmVVXrwL6540c66b75b27.png然后我有名称对应的丰度表,比如
attachments-2023-10-YjVNOCqX6540c6da7b89b.png
显示不全,看着不对应,实际上是几万行相互对应的,我现在想知道每个分类层级那些物种都有多少丰度,就用代码

attachments-2023-10-vJEf5jgM6540c7bd73ea2.png生成了3个文件,
随便看一个
attachments-2023-10-ud4BevrS6540c8d79e9a3.png就是order级别各个物种在不同样本里的丰度占比

这个在功能注释里用的更多,有兴趣可以看一下,具体代码见文章

https://www.omicsclass.com/article/2329


  • 发表于 2023-10-31 17:32
  • 阅读 ( 764 )
  • 分类:软件工具

你可能感兴趣的文章

相关问题

0 条评论

请先 登录 后评论
xun
xun

电路元件工程师

82 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 702 文章
  2. 安生水 351 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. xun 82 文章
  6. rzx 78 文章
  7. 红橙子 78 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章