InterProScan-蛋白质预测
InterProScan是InterPro数据库提供给用户的一个软件包，通过集成数据库鉴定蛋白质功能、所属的家族及其包含的结构域和位点
InterPro是一个数据库，它集成了许多数据库关于蛋白质功能的预测信息，概述了蛋白质所属的家族及其包含的结构域和位点。InterProScan是InterPro数据库提供给用户的一个软件包，以集成的方式从InterPro数据库中进行结果检索。InterProScan可以检索的数据库如下：
InterProScan的一般使用方法：
sh interproscan.sh -i pep.fa -f TSV -o out
-i：待检索的蛋白质序列文件，fasta格式
-f：输出文件的格式，可选TSV, XML, JSON,GFF3
-o：输出文件名
除此之外还有其他参数帮助我们更好的进行个性化的检索，比如通过-appl参数选择要搜索的库（默认全选）：
具体使用参数详见官方网站：https://interproscan-docs.readthedocs.io/en/latest/HowToRun.html
tsv格式文件解读：
- 发表于 2023-12-12 16:15
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