GATK 4.4.0报错“ A JNI error has occurred, please check your installation and try again”
报错
在利用GATK进行markdup和variant calling的时候出现报错：
报错的主要信息用红框框出了，错误信息是：错误为发生JNI错误，请检查安装并重试。
出现报错的原因：
1. javac与java版本...
报错
在利用GATK进行markdup和variant calling的时候出现报错：
报错的主要信息用红框框出了，错误信息是：错误为发生JNI错误，请检查安装并重试。
出现报错的原因：
1. javac与java版本不同所致，可以采用以下方法进行检查。如果真的不一致就安装或者指定一个一致的。
javac -version
java -version
2. 安装了多个版本的JDK，可以把不匹配的都卸载了，留下一个。
3. GATK编译错误。需要重新安装编译GATK。
参考：
- 发表于 2024-03-25 11:54
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- 分类：软件工具
