qsub任务投递系统的常用命令 SGE任务调度

qsub全称为”Queue Submitter”,是Sun Grid Engine (SGE)集群管理软件中的一个命令行工具。它的主要作用是将用户提交的任务加入到队列中,等待计算节点执行。qsub可在Unix/Linux等操作系统下使用...

qsub全称为”Queue Submitter”,是Sun Grid Engine (SGE)集群管理软件中的一个命令行工具。它的主要作用是将用户提交的任务加入到队列中,等待计算节点执行。qsub可在Unix/Linux等操作系统下使用,是高性能计算集群中提交任务的标准方式之一。

1. 命令格式

qsub [-ACdfklmnpqtTv] [-@ 条件] [-a 开始时间] [-A 账户] [-b y/n] [-c n] [-C 目录] [-cwd] [-e 错误文件] [-h] [-I] [-j y/n] [-js 脚本] [-l 资源] [-m y/n] [-M 邮件地址] [-N 作业名称] [-o 输出文件] [-p 优先级] [-P 项目] [-r y/n] [-S 解释器] [-u 用户] [-v 环境变量] [-V] [-w 类型] [-W 等待时间] [-x] [脚本]

2. 常用参数

(1)-l 资源:指定作业执行要求的资源,如使用节点数、CPU数量、内存大小等。

(2)-N 作业名称:指定作业的名称,方便管理和查找。

(3)-o 输出文件:指定标准输出文件的名称。

(4)-e 错误文件:指定标准错误输出文件的名称。

(5)-p 优先级:指定作业执行的优先级。

(6)-q 主机名:指定要使用的计算节点。

(7)-S 解释器:指定作业使用的解释器。

(8)-V:将环境变量传递给脚本中的程序。

3. 使用

假设存在这样的脚本job.sh

#!/bin/bash
#$ -N test 
#$ -cwd
#$ -l nodes=1:ppn=8
echo “hello, world!”

提交:

qsub job.sh

这样就提交了一个任务,job.sh主要是创建一个名为test的作业,要求使用1个节点8个CPU核心,使用默认的工作目录并输出”hello, world!”

4. 常见指令

查看自己的任务

qstat -u username

qstat -f   #查看所有任务

查看详细任务

qstat -j jobid

删除某个任务

qdel [-W delay|force]  jobid
#强制删除
qdel -W force jobid
#过段时间删除,需要写删除作业前需要等待的时间
qdel -W delay time jobid


参考资料:

有关qsub在Linux下的使用指南 (qsub linux) – 后浪云 (idc.net)

qsub使用简介-CSDN博客

  • 发表于 2024-06-26 17:54
  • 阅读 ( 1031 )
  • 分类:软件工具

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