libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错

libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错

R导入ChIPseeker包时出现下面报错:

Error: package or namespace load failed for ‘ChIPseeker’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '/share/work/biosoft/R/R-v4.2.0/lib64/R/library/data.table/libs/data_table.so':
  /share/work/biosoft/lib/libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found (required by /share/work/biosoft/R/R-v4.2.0/lib64/R/library/data.table/libs/data_table.so)

原因是 /share/work/biosoft/lib/libgomp.so.1库的版本太旧,无法满足data.table所需的GOMP_4.5符号版本。

解决方法将新的库加到环境变量里:
export LD_LIBRARY_PATH=/share/work/biosoft/R/R-v4.2.2_meta/lib64/R/library/:$LD_LIBRARY_PATH
  • 发表于 2024-08-22 15:05
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  • 分类:R

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安生水
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