R语言绘制维恩图空值NA处理
行数不同的数据读入R，批量去除NA，绘制韦恩图。
绘制venn图的时候，我们数据的ID中有缺失值，也就是不同的ID行数不一样，需要绘制韦恩图，那么空值就读成了NA，需要去除才行；
数据如下，不同比较组的得到的差异基因ID，需要用R绘制韦恩图：
代码及注意事项如下：
library(Vennerable)
#由于行数不一样，设置fill参数；na.strings 设置空值为NA：
All_DEG_venn<-read.table("All_DEG_venn.genes",header=TRUE,comment.char="",sep = "\t",check.names=FALSE,fill=T,na.strings="")
colnames(All_DEG_venn)<-c("DAF2 vs GDAF2","DAF5 vs GDAF5","DAF11 vs GDAF11","DAF16 vs GDAF16")
#去除数据中的NA，以免多计数
All_DEP_ID=apply(All_DEG_venn,2,na.omit)
datav<-Venn(All_DEG_venn)
plot(datav,doWeight=F,type="ellipses")
- 发表于 2018-07-05 16:16
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- 分类：R
