Trinity报错“Error, not recognizing read name formatting”

在使用trinity做de novo的时候,发现软件报错了

在使用trinity做de novo的时候,发现软件报错了:

attachments-2024-12-lmZ1VgaW676261fdb14de.png该报错指出fastq文件的reads名称不符合要求,于是查看了一下:

attachments-2024-12-MJDkbhgX6762629167713.png通过查询报错信息,认为可能是当前的reads名称让软件无法鉴别双端测序序列,于是做了如下的处理:

attachments-2024-12-P9wfUIWW67626e5d360af.png

处理过之后的fastq文件:

attachments-2024-12-Qzb33Pua67626d438cb48.png

fastq2:

attachments-2024-12-jd3w8bKU67626d5916e1b.png然后就能跑通了:

attachments-2024-12-SmiP0gtp67626db2f02dc.png

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