samtools | 提取部分染色体的bam信息

01. samtools提取bam文件中某部分染色体相关信息 samtools view -b -h XX.bam chr1 chr4 >XX2.bam 02. samtools构建bam文件的索引 samtools index XX2.bam

01. samtools提取bam文件中某部分染色体相关信息

samtools view -b -h XX.bam chr1 chr4 >XX2.bam

02. samtools构建bam文件的索引

samtools index XX2.bam

03. samtools查看bam文件内容

samtools view XX2.bam |ee

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