组学大讲堂云服务器conda环境配置:

组学大讲堂云服务器conda环境配置:



组学大讲堂云服务器conda 已经安装, 大家如果需要使用 conda安装服务器上没有的软件可以运行以下命令配置一下:

1.添加conda命令到环境变量PATH中:


echo 'export PATH=$PATH:/share/biosoft/conda/miniconda3/bin/' >>~/.bashrc


2.添加初始化conda环境:

conda init


3.conda环境加速,添加清华镜像,并设置默认不进入base环境:


echo '
channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/pro
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
auto_activate_base: false
' >~/.condarc


4.退出重新登录服务器设置生效;


5. conda 基础使用


conda create -n myenv #创建软件环境,取名myenv 这个自定义
conda activate myenv #激活软件环境进入
conda install numpy #安装软件
conda deactivate  #退出环境
  • 发表于 1天前
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  • 分类:linux

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