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常见的OrgDB包，方便对应物种注释

列举了19个OrgDB，物种对应的全基因组注释R包，方便根据EntreZ进行基因的注释分析等等物种 OrgDB 按蚊（Anopheles） org.Ag.eg.db 拟南芥（Arabidopsis） org.At.tair.db 牛（Brov...

列举了19个OrgDB，物种对应的全基因组注释R包，方便根据EntreZ进行基因的注释分析等等

物种	OrgDB
按蚊（Anopheles）	org.Ag.eg.db
拟南芥（Arabidopsis）	org.At.tair.db
牛（Brovine)	org.Bt.eg.db
蠕虫（Worm）	org.Ce.eg.db
犬（Canine）	org.Cf.eg.db
苍蝇（Fly)	org.Dm.eg.db
斑马鱼（Zebrafish）	org.Dr.eg.db
大肠杆菌 strain K12（E coli strain K12）	org.EcK12.eg.db
大肠杆菌strain Sakai(E coli strain Sakai)	org.EcSakai.eg.db
鸡（Chicken）	org.Gg.eg.db
人（Humanm)	org.Hs.eg.db
小鼠（Mouse）	org.Mm.eg.db
恒河猴（Rhesus）	org.Mmu.eg.db
疟原虫（Malaria）	org.Pf.plasmo.db
黑猩猩（Chimp）	org.Pt.eg.db
大鼠，褐家鼠（Rat)	org.Rn.eg.db
酵母（Yeast)	org.Sc.sgd.db
猪（Pig)	org.Ss.eg.db
爪蟾(Xenopus)	org.Xl.eg.db

注：全基因组注释，由EntreZ对应多个数据ID和信息

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发表于 2018-07-05 22:47
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