AI写代码之批量设计引物

我们拿到一段序列之后想要设计引物通常会使用ncbi或者是primer3工具,而这些工具的在线版本都只能一个一个序列去设计,比较耗费时间,最好是使用本地版。在这里我让AI告诉我怎么做,只要阐述清...

我们拿到一段序列之后想要设计引物通常会使用ncbi或者是primer3工具,而这些工具的在线版本都只能一个一个序列去设计,比较耗费时间,最好是使用本地版。在这里我让AI告诉我怎么做,只要阐述清楚自己的需求,AI就是很好的工具!

在这里我的需求是:有一组序列,里面包含了上游300bp+目标序列+下游300bp,针对这样的一组序列设计引物

对话如下:https://www.doubao.com/thread/w5cc95d3b3e11aac8


它首先会告诉你设计引物的逻辑和工具:


attachments-2025-03-XccGUAhx67d7ed0face22.png

接下来可以进一步阐述清楚自己的需求,比如说我想用本地版本的primer3,它会从软件下载开始给予指导:


attachments-2025-03-wPPp05bO67d7ed4e1864a.png

再细化自己的需求,我这边告诉他输入文件的格式,要求他给我做primer的配置文件并且运行:


attachments-2025-03-tZspKboI67d7ed9bc3ce0.png

更详细的信息大家可以去看我分享的对话。

当然使用AI的前提是自己有一个比较基础的了解,不然很难细化清楚自己的需求。


对于primer3配置文件的解释大家可以学习以下链接的内容:

自动化引物设计(一)—Primer3教程 - 知乎

  • 发表于 2025-03-17 17:40
  • 阅读 ( 118 )
  • 分类:软件工具

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Ti Amo
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