18年上半年，利用GEO/TCGA数据库发表文章超过1000+
前几期小编给大家介绍了几篇利用GEO数据库、TCGA数据库发表的SCI论文：如：
1：An integrated lncRNA, microRNA and mRNA signature to improve prognosis prediction of colorectal cancer ，该文采用TCGA数据库中结直肠癌及癌旁组织的mRNA，lncRNA,miRNA进行差异表达，获得显著变化的分子，用于构建生存分析模型，获得疾病风险评估方法。
2：Elevated circulating miR-182 acts as a diagnostic biomarker for early colorectal cancer，该文章利用公共数据（GEO，TCGA数据），筛选出两个miRNA（miR-182 and miR-20a）作为结直肠癌诊断的分子标志物，然后在组织和血液中进行验证，最终确定诊断参数。
3：Expression profiles analysis identifies anovel three-mRNA signature to predict overall survival in oral squamous cellcarcinoma，利用GSE13601,GSE30784, GSE37991三个mRNA芯片表达数据以及TCGA中OSCC表达数据分别做对照和患者差异基因分析及GO和KEGG通路富集分析、PPI网络分析，IPA通路分析，生存分析等，最终筛选到PLAU, CLDN8 and CDKN2A与OSCC预后相关，并且在另一个GEO数据GSE41613中得到了验证。
类似文章还有千千万，这里就不一一列举了，但仔细看来，发现这类文章具有类似的思路构架，这里我们不妨归纳一下此类文章的套路，如下：
这类文章18年到底还好不好发？我带着这个疑问搜索了下2018年1-7月10日此类文章发表数量才发现，原来有这么多人在闷声发文章：利用GEO数据库，2018年1-7月10日期间共发表了433篇；而利用TCGA数据库，1-7月间共发表文章846篇；真是不少！当你在实验室兢兢业业做实验的时候，别人就在悄无声息地利用你公开的数据，整理自己的论文！你是不是也该开开窍了呢？
小编为了大家查阅18年最新的此类文章方便，特地将2018年利用GEO数据库和TCGA数据库发表的所有文章信息整理成EXCEL；此表包含信息如下：文献题目、期刊名称、期刊影响因子、一作姓名、通讯作者姓名、发表时间、全文下载链接、一作单位名称，如下图：（文末有索取该Excel列表的方法）
从上表中可以看到，此类文章影响因子最高到30+，也不乏8、9，更有1以下的；这类文章比起从实验做起时间耗费要短的多，是真正的短平快类型的文章。无论你是没经费，还是没材料；是没基础，还是没思路，都可以按照以上文章思路来一篇，这一套分析下来，不仅仅一篇论文有内容了，更是开创了一个有待深入挖掘、验证的课题了。
怎么样？你是不是有点心动呢？那赶快行动起来，今年先定个小目标：两篇起步！
获取数据库文章Excel列表方法：
请先关注“组学大讲堂”微信公众号，然后在公众号对话框内发送 “数据库文章列表” 即可获得该Excel版数据库挖掘文章列表。
- 发表于 2018-07-23 11:42
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- 分类：TCGA
