Mapman对表达数据进行venn绘制
Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外，还可以利用软件之际对多样品数据中注释到Mapmen通路的数据进行venn图绘制。主要操作过程如下：
从Experiments导入表达数据,具体参考文章：植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman
按shift 或者ctrl，进行多样品选中，再右键选择venn diagrams，或者在主界面选中venn diagrams，即可进行图片绘制以及阈值设置，之后可根据分析结果，了解venn图每一个区域内注释到的基因的情况。
1、途径1-选中样品，右键选中venn diagrams 在弹出框中选中mapping进行分析
2、在主界面选中show data using venn diagrams, 弹出的窗口中确定样品与mapping进行绘图
3、参数修改与结果
venn图绘制结果页面涉及两个参数选项：
threshold：阈值，只有当选择的样品中能够注释到具体通路的基因相关的表达数据满足该标准，才会出现在同一区域，譬如下调中间重叠区域表面两组数据都满足这一阈值的结果有232个基因。
two sided：正负条件，例如下图阈值为2，选择该选项，则要求两组样品同时大于2或者小于-2，不选择仅表示同时大于设定值。
注意，每个区域数据的具体情况，单击该区域的数字即可在下方显示详细数据结果。venn图绘制最多不超过四个样品。
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- 发表于 2018-08-02 14:01
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- 分类：软件工具
