Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 分析软件 IsoSeq3 的安装
参考官方的安装说明，采用Anaconda 进行安装，步骤如下：
1 下载最新版本的Anaconda
2 参考安装说明，安装Anaconda。并将Anaconda的bin目录加入到系统PATH环境变量
3 测试conda是否安装成功，并更新到最新版本
conda -V
conda update conda
4 创建一个虚拟环境,命名为anaCogent5.2(这个名字可以自己定义），采用python 2.7版本
conda create -n anaCogent5.2 python=2.7 anaconda
source activate anaCogent5.2
5 配置国内镜像，加快软件安装速度
有时候，安装这些包的速度比较慢，还可能中断，主要原因是Anaconda的服务器在国外。可以换成国内的镜像，加快下载速度。目前清华大学那边提供了镜像，其配置方法如下：
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
6 安装依赖包biopython bx-python
conda install -n anaCogent5.2 biopython
conda install -n anaCogent5.2 -c http://conda.anaconda.org/cgat bx-python
7 安装iso-Seq3 和 LIMA
conda install -n anaCogent5.2 -c bioconda isoseq3
conda install -n anaCogent5.2 -c bioconda bamtools
conda install -n anaCogent5.2 -c bioconda pysam
