R语言-相关性矩阵分析

R语言-相关性计算

R内置函数 cor() 可以用来计算相关系数:cor(x, method = c("pearson", "kendall", "spearman")),可计算pearson、kendall、spearman三种相关系数。

cor函数计算的是列与列间的相关系数,得到的举证C(i,j)是第i列与第j列相关系数。 

例如如下数据:

log2Ratio_miR   log2Ratio_Gene
-1.43072567351625       1.37874741391777
-1.43072567351625       1.11756970634256
-1.43072567351625       1.67994238012443
-1.43072567351625       3.05079253633835
-1.43072567351625       1.50329494091278
-1.43072567351625       1.18612566219656
-1.43072567351625       1.89027598062113
-1.43072567351625       3.50870147552217
-1.43072567351625       1.06781330535694
cor计算相关性结果:

attachments-2018-08-TQqUeSKe5b766343c44d7.jpg



  • 发表于 2018-08-17 13:56
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  • 分类:R

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安生水
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