LncBase: 一个预测人类miRNA 靶向lncRNA的网站

LncBase: 一个预测人类miRNA 靶向lncRNA的网站

在构建ceRNA网络中,需要预测miRNA 靶向lncRNA。 我们可以采用targetscan, miRanda, RNAhybrid等软件进行预测,也可以采用在线的预测网站,今天就介绍一下LncBase。 

1. 网站支持两种预测模式:基于实验验证的预测和电子预测两种模式

attachments-2018-09-Rzu19blM5ba072f6778ac.jpg


2. 使用比较简单:输入miRNA 和lncRNA的编号即可,适合少量的miRNA和lncRNA 预测

attachments-2018-09-nVGJoMNr5ba07358da526.jpg3.  支持数据库下载:如果分析miRNA或lncRNA较多的话,可以将该数据下载到本地,在本地进行预测分析 



如果您对TCGA数据挖掘感兴趣,请学习我的TCGA系列课程:

  • 发表于 2018-09-18 11:42
  • 阅读 ( 17685 )
  • 分类:lncRNA

1 条评论

请先 登录 后评论
microRNA
microRNA

115 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 698 文章
  2. 安生水 347 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. xun 82 文章
  6. 红橙子 78 文章
  7. rzx 74 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章