我们下载KEGG数据库的目的是为了研究目标蛋白参与了那些pathway 。 前面我们介绍了KEGG 数据库中蛋白序列的下载方式，现在来介绍一下patyway 相关数据的下载方式。这个主要采用KEGG 的API 进行获取，思路如下：
1. KEGG 有那些pathway ?
访问的API地址是：
http://rest.kegg.jp/list/pathway
通过该API ，可以获得所有pathway的列表。
2. pathway 上有那些KO （KEGG 中的ID编号）
访问的API地址是：
http://rest.kegg.jp/link/ko/map00010
其中map00010 就是对于的pathway 图的编号，通过遍历所有的pathway ,就可以kegg 数据库中跟pathway 相关KO。
3. KO 对应的蛋白编号是哪个？
访问API地址：
http://rest.kegg.jp/link/genes/K00500
其中K00500 就是我们在第二步中获得的KO， 通过遍历所有的KO，就可以获得在KO在不同物种中的基因（蛋白）编号。
通过这3个步骤，我们就可以获得了从蛋白到pathway, 相关的对应信息，通过该注释，我们就可以多不同物种的基因进行pathway 分析。
