ceRNA(Competing endogenous RNA):内源性的竞争型RNA。这类RNA能相互竞争性的同miRNA结合，所以他们之间存在一定的相互作用。
目前在TCGA中研究比较多的是lncRNA, 编码蛋白的基因以及miRNA 三者之间的ceRNA调控网络。
构建ceRNA 网络，需要进行两类分析：
1. 差异表达分析： 分别对lncRNA, 编码蛋白的基因，miRNA 进行差异表达分析，获得差异表达的分子，进行下游的分析
2. miRNA靶位点预测：分别预测一下差异表达的miRNA 能调控哪些差异表达的lncRNA,和编码蛋白的基因。
有了上面的两个分析，基本上就可以构建ceRNA调控网络。但是也有几个问题需要考虑：
1. miRNA 靶位点太多： 由于miRNA和靶位点的相互作用不能很强，主要是靠2-8位的序列，这就导致特异性比价差，建议结合实验数据，对靶位点进行验证，获得可靠的调控关系信息。
2. lncRNA与编码蛋白基因间的相关性： 基于ceRNA理论，竞争性的分子间存在着一定的协同相关性，可以基于分子间的相关性，对构建的ceRNA网络进行优化
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