3分2区蛋白质组学文章怎么写？
随着转录组测序类文章的发文难度不断提高，越来越多的课题组开始了蛋白质组学方面的研究，其中尤以TMT/iTRAQ火热。那么，蛋白质组学类文章该如何撰写呢？好发么？在这里，小编给大家带来一篇今年9月份发表在BMC Plant Biology上的蛋白质组学文章。
材料方法
1、水稻黑条矮缩病毒RBSDV感染玉米幼苗作为感染组，另有健康玉米幼苗作为对照组，随机选取5株幼苗作为一个生物学重复。感染组和对照组各3个生物学重复，共6个样品；
2、针对RBSDV的S6区段设计引物，用于RBSDV拷贝数的测定；
3、TMT标记；
4、蛋白质进行GO和KEGG注释；
5、QRT-PCR验证。
结果分析
1、共鉴定出7615种蛋白质，其中6319种蛋白可以定量，并进行了GO、KEGG、功能域预测、亚细胞定位等分析；
2、通过差异分析鉴定了116个差异蛋白DAPs，其中35个上调，81个下调；
3、对鉴定出来的所有蛋白进行GO分析和亚细胞定位分析；
4、对差异蛋白进行富集分析，包括GO、KEGG富集分析；
5、分析发现，15个显著上调或下调的蛋白涉及6个代谢通路；
6、挑选了6个关键的RBSDV应答基因进行qRT-PCR验证。
最后结合前人的研究和自己的结论进行讨论，并展望；一篇3.930分的二区文章就完成了。
总的来说，这篇文章思路清晰，设计简单，没有什么复杂的实验，值得初学者借鉴。
另外，蛋白质组学分析有一些基本的知识点，大家可以在我们组学大讲堂问答社区（www.omicsclass.com.cn）进行问题搜索。
需要文章原文的老师请关注“组学大讲堂”微信公众号，转发该文章至您的朋友圈并截图，然后在公众号对话框内发送截图证明并留言 “玉米蛋白质组” 即可获得原文献！（注意关键词需写全）。
更多生物信息课程：
1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读
3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提升你的文章档次，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析
4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读
5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程
6. 生物信息入门到精通必修基础课，学习链接：linux系统使用、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图
7. 医学相关数据挖掘课程，不用做实验也能发文章，学习链接：TCGA-差异基因分析、GEO芯片数据挖掘、GSEA富集分析课程、TCGA临床数据生存分析、TCGA-转录因子分析、TCGA-ceRNA调控网络分析
8.其他课程链接：二代测序转录组数据自主分析、NCBI数据上传、二代测序数据解读。
- 发表于 2018-11-23 15:51
- 阅读 ( 5851 )
- 分类：蛋白质组学
