Illumina microarray未标准化数据分布
不同于affy包对affymetrix芯片数据分布绘图，Illumina microarray数据分布是基于lumi包：
boxplot-method
density-method
affy包也可以利用boxplot，不过密度图确实利用hist,此处就展示一...
不同于affy包对affymetrix芯片数据分布绘图，Illumina microarray数据分布是基于lumi包：
| density-method（或者hist) |
affy包也可以利用boxplot，不过密度图利用hist,此处就展示一些lumi包针对Illumina microarray绘图过程（GSE63229）：
基于lumiR.batch获取LumiBatch对象，直接基于对象画图：
> n.sample = length(LumiBatch$sampleID) > cols=rainbow(n.sample) > par(cex = 0.7) > if(n.sample>40) par(cex = 0.5) > boxplot(LumiBatch,col = cols, las = 2)
密度图则是(hist同样效果）：
> par(cex = 0.7)
> if(n.sample>40) par(cex = 0.5)
> density(LumiBatch,col = cols, las = 2)
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- 发表于 2018-12-07 17:23
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- 分类：R
