Linux生物信息分析环境搭建

想做生物信息分析,但不知道怎么入门?先来搭个环境吧!想分析数据,但是分析不了?先来搭个环境啊!搭建好环境,后面的自然就简单多了。 我们平时大都会使用Windows,而很少使用Linux,然而做...

想做生物信息分析,但不知道怎么入门?先来搭个环境吧!想分析数据,但是分析不了?先来搭个环境啊!搭建好环境,后面的自然就简单多了。attachments-2018-04-zVcDemdx5adca520b5083.png

我们平时大都会使用Windows,而很少使用Linux,然而做生物信息分析是需要用Linux的啊,而且听人说安装Linux很麻烦的啊。其实很简单,只需要简单几步就可以使用Linux啦。


哦?那怎么弄呐?首先我们需要一个虚拟机——VirtualBox,然后再有一个Linux系统的ova包,最后,把ova导入虚拟机,之后我们就可以愉快的使用Linux啦。我们第一节课教你搭建Linux系统。

linux是有了,但是怎么用呢?哼哼,Linux都有了还愁用不了吗!第二节课就教你怎么使用Linux。

Linux有了,而且也会用了,那怎么编写代码并在Linux上运行呢?哈哈,很简单啊,第一步编写代码,第二步运行代码。呵呵,能具体点不!来看我们第三节课啊。


除此之外,我们还可以实现Windows和Linux的文件共享,实现linux和Windows文件无缝对接。并且我们使用的bio-linux还安装了大量生物信息分析的软件和包哦,软件太多,只列一小部分吧。生物信息常用的软件:perl、R、python、blast、hmmer、bwa、bowtie等一系列软件,转录组,重测序,微生物16S等分析都可以在此系统下完成。

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教学视频永久免费哦!详情请关注组学生物公众号。


观看方式:

电脑上打开网易云课堂(网址:http://study.163.com/)。检索找到“组学大讲堂”,会有相关视频。

  • 发表于 2018-04-22 23:08
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  • 分类:linux

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安生水
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