VirusDetect-小RNA鉴定病毒
VirusDetect-小RNA鉴定病毒
病毒的类别很多，而且是寄生在宿主中，不容易发现。采用高通量的测序方法，可以鉴定一些生物是否被病毒侵染，鉴定一些新的病毒。
采用小RNA测序鉴定病毒的基本策略主要包括以下3步：
1. 测序数据与宿主基因组进行比对，过滤掉来源于宿主的序列
2. 没有比对上的序列，进行denovo 组装
3. denovo 的序列与已知的病毒库进行比对，找到相似度高的病毒序列
VirusDetect 是一个小RNA鉴定的病毒的分析流程，非常的好用，并且能提供不同类别的病毒参考数据。
VirusDetect分析流程图如下：
- 发表于 2019-03-08 09:51
- 阅读 ( 4282 )
- 分类：转录组
