在线绘制聚类热图(heatmapper)

在线绘制聚类热图的方法,3分钟学会!

聚类热图是转录组测序类文章中常见的一种分析内容。今天小编就给大家讲解一个在线绘制聚类热图的方法。

我们使用的在线工具网址:

http://www.heatmapper.ca/expression/

打开后的页面是如下所示:

attachments-2019-04-UNgZdZAy5cbe664b510f0.jpg

该在线工具有几个优点:

1、支持不同的颜色配置;

2、支持样品和基因的双聚类;

3、支持基因名称的显示;

4、支持多种格式图片的下载。

绘图之前,需要准备相应的数据文件。在这里小编使用的是基因的表达量数据来绘制聚类热图。

attachments-2019-04-BArtdf4C5cbe6677630d0.jpg数据文件准备好之后,需要把该文件上传,上传完成之后需要稍等片刻(在线工具有延时),右侧图形展示区域就会显示聚类热图。再根据右侧参数进行相应设置即可完成聚类热图的绘制。

attachments-2019-04-ZmU8747o5cbe668767a65.jpg如果基因数目比较多,基因名称显示会不清晰,我们可以将图片下载下来,然后再使用其他软件进行修改,比如使用AI进行修改。

更多生物信息课程:

1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程基因家族文献思路解读

2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读转录组(无参)结果解读

3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析

4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘转录组文献解读

5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读OTU网络图绘制cytoscape与网络图绘制课程

6. 生物信息入门到精通必修基础课,学习链接:linux系统使用perl入门到精通perl语言高级R语言画图

7. 医学相关数据挖掘课程,不用做实验也能发文章,学习链接:TCGA-差异基因分析GEO芯片数据挖掘GSEA富集分析课程TCGA临床数据生存分析TCGA-转录因子分析TCGA-ceRNA调控网络分析

8.其他课程链接:二代测序转录组数据自主分析NCBI数据上传二代测序数据解读

  • 发表于 2019-04-23 09:14
  • 阅读 ( 14564 )
  • 分类:科研作图

0 条评论

请先 登录 后评论
生信老顽童
生信老顽童

61 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 700 文章
  2. 安生水 348 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. xun 82 文章
  6. 红橙子 78 文章
  7. rzx 75 文章
  8. CORNERSTONE 72 文章