如何将基因组的注释文件gff转化成基因的注释文件gtf

在做分析的时候,有时候我们需要将gff文件转化为gtf,如何转化呢? 这里有一个小工具,虚拟机的bio-linux自带不需要安装,就是gffread: 命令行格式:gffread   gff文件   -T  -o  gtf文件,...

在做分析的时候,有时候我们需要将gff文件转化为gtf,如何转化呢?

这里有一个小工具,虚拟机的bio-linux自带不需要安装,就是gffread:

命令行格式:gffread   gff文件   -T  -o  gtf文件,这里比较容易出错的就是大写T,小写o!

  • 发表于 2018-05-11 10:55
  • 阅读 ( 6385 )
  • 分类:软件工具

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landy
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