Upset 图(Upset Plot)是一种用于可视化集合间交集的图表,是传统维恩图的替代方法,特别适用于集合个数多或交集关系复杂的场景。它通过柱状图、点图和辅助条形图来直观展示集合交集的大小及分布。
R 安装github包报错:
expression()函数是没办法同时代入公式和变量,这个时候我们可以使用另一个函数来替代——bquote()
10x公司的空间转录组的数据一般有两种获取方式,第一是手里直接拿到有matrix和img文件(当然还需要对应的barcord和json等辅助文件),第二是公司直接提供或者从网络上下载到的原始数据,fq文件,那我...
R语言基础入门—数据结构(2)
R语言基础入门—数据结构(1)
R语言基础入门—R语言概述与安装!
Upset图绘制
这个错误通常发生在尝试使用R的install.packages函数安装新的包时。错误信息"fail to lock directory"意味着R不能锁定用于安装包的目录,这通常是因为之前的安装进程没有正确完成,导致锁文件(一个隐藏的文件,用于防止同时写入目录)仍然存在。
R语言绘制多分组差异分析结果图 加载需要的包 2 设置FC和FDR的阈值线 4.3 读入数据
unable to load shared object '/home/wanghj/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/00LOCK-igraph/00new/igraph/libs/igraph.so': libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such fi...
R语言绘制差异表达火山图
R语言中%>% 作用
libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错
如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组,然后使用filter函数结合any函数来判断每个分组是否满足特定条件并进行过滤。
绘制全基因组甲基化图谱
当使用循环跑R函数的时候,如果其中某一次循环执行时报错,那么就会中断循环体,并在屏幕上打印出报错信息
我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候,需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包
解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题
eQTpLot 是一个直观且用户友好的 R 包,专为可视化 eQTL 和 GWAS 结果的共定位而开发。eQTpLot 将标准 GWAS 和 eQTL 统计结果以及可选的成对 LD 信息作为输入,以生成一系列图表,可视化给定基因-性状对的 eQTL 和 GWAS 信号之间的共定位、相关性和富集。