R语言绘制维恩图空值NA处理

行数不同的数据读入R，批量去除NA，绘制韦恩图。

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-07-05 16:16
• 阅读 ( 8932 )

Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色

Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色。

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-07-04 12:02
• 阅读 ( 9525 )

统计不同分组差异表达结果并统计上下调基因数目并绘制柱状图

R统计不同差异组合，上下调基因个数；并用ggplot2绘制柱状图。

• 1
• 1
• omicsgene
• 发布于 2018-07-03 14:02
• 阅读 ( 12180 )

R语言统计相同ID出现的频率并用ggplot2绘制柱状图

统计相同ID出现的频率，并用ggplot绘制柱状图；

• 1
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-07-01 15:46
• 阅读 ( 9378 )

R语言统计数据范围并用ggplot2绘制柱状图

R语言，按数值范围统计频次，绘制柱状图

• 3
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-07-01 15:33
• 阅读 ( 9170 )

R语言统计数据范围并用ggplot2绘制饼图

按范围统计数值分布，并用ggplot2绘制饼图；

• 1
• 2
• omicsgene
• 发布于 2018-07-01 15:22
• 阅读 ( 8656 )

R处理大数据时内存out of memory的问题

R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题，相关解决方法： 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况（MB） 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memo...

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-29 13:16
• 阅读 ( 3952 )

R 删除重复数据

R 删除重复数据的方法，包括duplicated 和unique 针对duplicated, 对向量的元素或数据框的行进行操作的时候，返回逻辑值，以下面的数据框为例：  dat   A B C D1  a b a c2  c k b d3  c k c c4...

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-27 22:00
• 阅读 ( 4262 )

Hierarchical clustering主要聚类方法与R语言中聚类函数的应用

系统聚类Hierarchical clustering（层次聚类、谱系聚类）— 最短距离法（single linkage)— 最长距离法 （complete linkage)— 中间距离法 （median method)— 可变距离法 （flexible median)— 重心...

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-22 12:11
• 阅读 ( 6537 )

ggplot2几何设置——geom

列举ggplot2的geom设置内容，方便查找绘图对应方法

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-22 09:59
• 阅读 ( 5176 )

readxl包读取excel的多个函数简介

readxl包括多个可以读取excel的函数，比之xlsx包更方便

• 0
• 1
• Daitoue
• 发布于 2018-06-15 16:09
• 阅读 ( 7103 )

火山图--ggplot2

利用ggplot2进行火山图的绘制

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-15 09:59
• 阅读 ( 7249 )

melt函数对数据进行整合

借助reshape2包melt函数对数据进行整形处理，改变数据组合方式

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-15 09:30
• 阅读 ( 2983 )

绘制类似于箱线图的散点图

使用R语言绘制类似于箱线图的散点图

• 0
• 0
• 安生水
• 发布于 2018-06-08 12:06
• 阅读 ( 5733 )

如何将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)或者Symbol

AnnotationDbi 和 结合物种对应的注释文件，将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)

• 2
• 4
• Daitoue
• 发布于 2018-06-07 18:30
• 阅读 ( 36416 )

subset提取符合条件的数据

利用subset针对数据框按照条件进行判断和筛选数据

• 1
• 2
• Daitoue
• 发布于 2018-06-06 21:06
• 阅读 ( 10952 )

Split划分数据

在R中利用split，借助数据的分类类型，对数据进行分组

• 0
• 1
• Daitoue
• 发布于 2018-06-06 20:40
• 阅读 ( 2982 )

linux系统当中源码安装R，无root权限安装

1.安装zlib1.2.5版本及以上 cd zlib-1.2.11 ./configure --prefix =/share/work/biosoft/zlib make make install 2.安装bzip cd bzip2-1.0.6 make -f Makefile-libbz...

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-06-02 18:03
• 阅读 ( 5740 )

igraph 包安装错误

Igraph软件安装错误

• 0
• 3
• omicsgene
• 发布于 2018-06-01 16:12
• 阅读 ( 7343 )

R-对NA 数据进行处理

对数据中存在的NA情况进行处理，替换或者删除

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-01 13:54
• 阅读 ( 2564 )