R语言统计数据范围并用ggplot2绘制饼图

按范围统计数值分布,并用ggplot2绘制饼图;

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-01 15:22
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R处理大数据时内存out of memory的问题

R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题,相关解决方法: 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况(MB) 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memo...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-29 13:16
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R 删除重复数据

R 删除重复数据的方法,包括duplicated 和unique 针对duplicated, 对向量的元素或数据框的行进行操作的时候,返回逻辑值,以下面的数据框为例:  dat   A B C D1  a b a c2  c k b d3  c k c c4...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-27 22:00
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Hierarchical clustering主要聚类方法与R语言中聚类函数的应用

系统聚类Hierarchical clustering(层次聚类、谱系聚类)— 最短距离法(single linkage)— 最长距离法 (complete linkage)— 中间距离法 (median method)— 可变距离法 (flexible median)— 重心...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-22 12:11
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ggplot2几何设置——geom

列举ggplot2的geom设置内容,方便查找绘图对应方法

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-22 09:59
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readxl包读取excel的多个函数简介

readxl包括多个可以读取excel的函数,比之xlsx包更方便

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 16:09
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火山图--ggplot2

利用ggplot2进行火山图的绘制

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 09:59
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melt函数对数据进行整合

借助reshape2包melt函数对数据进行整形处理,改变数据组合方式

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 09:30
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绘制类似于箱线图的散点图

使用R语言绘制类似于箱线图的散点图

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-08 12:06
  • 阅读 ( 5509 )

如何将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)或者Symbol

AnnotationDbi 和 结合物种对应的注释文件,将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-07 18:30
  • 阅读 ( 35609 )

subset提取符合条件的数据

利用subset针对数据框按照条件进行判断和筛选数据

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-06 21:06
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Split划分数据

在R中利用split,借助数据的分类类型,对数据进行分组

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-06 20:40
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linux系统当中源码安装R,无root权限安装

1.安装zlib1.2.5版本及以上 cd zlib-1.2.11 ./configure --prefix =/share/work/biosoft/zlib make make install 2.安装bzip cd bzip2-1.0.6 make -f Makefile-libbz...

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-02 18:03
  • 阅读 ( 5504 )

igraph 包安装错误

Igraph软件安装错误

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-01 16:12
  • 阅读 ( 7060 )

R-对NA 数据进行处理

对数据中存在的NA情况进行处理,替换或者删除

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-01 13:54
  • 阅读 ( 2353 )

R数据集合并

在进行数据集处理时,经常会合并两个数据集,这里说一下合并数据集常用的2个函数: 合并列:cbind 合并行:rbind 1.cbind cbind使用非常直观简单。当我们需要直接合并2个矩阵或数据框,不需...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-01 13:03
  • 阅读 ( 2874 )

aggregate对数据分组处理

利用aggregate对数据进行分组处理,包括分组求和,分组取均值,最大值,中位数等等

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-31 15:52
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R-常见的字符串处理方法

R语言中常见的基本字符串处理,涉及匹配、替换、分割、截取、大小写转换等等

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-31 14:28
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read.xlsx读取Excel文件

利用“xlxs"读取真Excel文件中的内容

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-25 13:28
  • 阅读 ( 8312 )

密度图--ggplot2

利用ggplot2绘制密度图,并直接在密度图上叠加另一组数据的密度曲线

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-25 13:01
  • 阅读 ( 7436 )