部分Rstudio快捷键 Ctrl - o 打开文件 Ctrl - Shift - C 取消注释或注释当前选定区域 Ctrl - f 查找搜索 Ctrl - = 查找替换
ggplot2 的geom()函数(几何对象)中常涉及图形元素的位置调整position,通过不同的参数调整可以使图片呈现不同的效果,主要的位置调整涉及如下方式: position 描述 dodge 避免重叠,并...
介绍不利用公式,而利用geom_bar(position)geom_text(postion)控制饼图文字的添加过程
不同几何对应所能对应的图形属性设置,以及默认的统计变换形式。 表格如下: geom stat aes geom_abline abine colour,linetype,size geom_area identity colour,fill,linetype...
R语言中可以将图片结果保存成pdf或者png,具体涉及两种方法: pdf()和png() 以ggplot2绘图结果: http://www.omicsclass.com/article/92 的图片保存为例 pdf(file = "p.pdf",width =1...
这里简单介绍两个隐藏图例的方法 其一利用引导元素guides实现: 譬如借用www.omicsclass.com/article/92 分组柱状图代码: library('ggplot2')library('reshape2')A = c("A","B","C","D","E"...
演示ggplot2几个默认的主题类型,直接套用对应的函数即可 数据参考 http://www.omicsclass.com/article/92 dat type Sample Num1 A sample1 902 B sample1 343 C sample1 ...
绘制饼图的过程中,利用ggplot2的geom_bar结合coord_polar实现,需要理解的点是饼图的排布是按照aes(fill)的因子顺序确定的。譬如数据如下 > dat type Num1 A 902 B 343 C 56...
R语言-相关性计算
MA图主要应用在基因组数据可视化方面,实现数据分布情况的展示。早期主要应用于DNA芯片数据,现在常用于高通量测序数据中基因差异表达分析结果的展示。 其计算公式如下: M一般做Y轴...
ggplot2绘图theme参数设置 theme(line, rect, text, title, aspect.ratio, axis.title, axis.title.x, axis.title.x.top, axis.title.y, axis.title.y.right, axis.text, axis.text.x, axis....
借助rmvnorm()生成一个多维正态随机矩阵 安装mvtnorm包 > install.packages("mvtnorm")> library(mvtnorm) 生成随机矩阵x=rmvnorm(n,mean=rep(0,nrow(sigma)),sigma=diag(length(mean)…)...
StatET是一个eclipse R语言高亮显示插件,可以高亮显示R语言代码。安装之前请在电脑中提前安装好R编译环境。 支持在Eclipse平台上(通过将代码发送到R)运行R代码 支持语法高亮显示 支持使用R代码模板 支持创建R的文档文件(*.Rd) 可以从Eclipse运行R命令
在进行数据处理的过程中,可能会要求删除向量中某个指定的元素,这一操作可以利用R 语言向量中每个元素都对应一个索引完成,而获取索引下标可以利用which(),而match()只会返向量中第一次出现的...
利用factor() 或者ordered() 两个函数将普通变量转换成有序因子。
利用GEOquery包的getGEO()可以进行芯片相关数据的下载,不过,有人反映不少芯片的表达矩阵下载经常出错,可以通过手动下载的方式将矩阵文件下载到对应的工作路径中: 矩阵文件的基本命名格式...
行数不同的数据读入R,批量去除NA,绘制韦恩图。
Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色。
统计相同ID出现的频率,并用ggplot绘制柱状图;
R语言,按数值范围统计频次,绘制柱状图