Pathway富集结果常用气泡图来显示,其基本代码如下: 案例数据: > dat ko_id Kegg_pathway Rich_factor Pvalue DEGs1 ko00195 ...
绘制堆叠柱状图,重点重点在于geom_bar中postion="stack", 数据参考:http://www.omicsclass.com/article/92 dat type Sample Num1 A sample1 902 B sample1 343 C sample1...
ggplot2分面设置facet_grid实现一页多图 facet_grid(facets, margins = FALSE, scales = "fixed", space = "fixed", shrink = TRUE, labeller = "label_value", as.table = TRUE, switch = N...
按范围统计数值分布,并用ggplot2绘制饼图;
利用subset针对数据框按照条件进行判断和筛选数据
利用aggregate对数据进行分组处理,包括分组求和,分组取均值,最大值,中位数等等
利用ggplot2绘制密度图,并直接在密度图上叠加另一组数据的密度曲线
Mean()求平均值 通过求出数据集的和再除以求和数的总量得到平均值 函数mean()用于在R语言中计算平均值。语法 用于计算R中的平均值的基本语法是 - mean(x, trim = 0, na.rm = FALSE, ...)...
R、R语言、文件读取、xlsx
1.从CRAN安装;2.使用BiocManager安装;3.从github安装
使用plot画图的时候,只是设定xy轴范围仍然在0之前会有一小段多出来的范围 例如:plot(runif(10,0,10),type="l",xlim=c(0,10),ylim=c(0,10)) 使用:xaxs/yaxs="i" 代码即可解决 例如:plot(r...
R包GOplot将GO富集分析结果可视化,绘制弦图
pheatmap 绘图出现报错信息类似: Error in hclust(d, method = method) : 外接函数调用时不能有NA/NaN/Inf(arg11)
UpSetR包绘制多维的venn图
R语言绘图颜色设置,绘制漂亮的图片。
R 检测是否有-Inf/Inf NA NaN
data.frame参数check.names
R语言中实现方差分析及其可视化
R语言中实现T检验及可视化
利用limma方法进行芯片数据差异表达分析就是那么简单!