单细胞转录组数据挖掘流程记录-CRC直肠癌(GSE178341)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-CRC直肠癌(GSE178341)

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-06-27 14:03
• 阅读 ( 1019 )

食管癌相关文章ESCC

食管癌相关文章ESCC

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-08-20 15:26
• 阅读 ( 954 )

食管癌 10X多样本（GSE145370）

食管癌 10X多样本（GSE145370）

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-08-22 16:48
• 阅读 ( 952 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-07-22 18:21
• 阅读 ( 894 )

10X Visium空间转录组图像

10X Visium空间转录组图像

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-09-19 13:20
• 阅读 ( 887 )

读 10X的空间转录组数据报错

读 10X的空间转录组数据报错

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-09-18 16:58
• 阅读 ( 859 )

非小细胞肺癌（GSE148071）

非小细胞肺癌（GSE148071）

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-08-16 15:10
• 阅读 ( 847 )

非小细胞肺癌 （GSE139555）

非小细胞肺癌 （GSE139555）

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-08-16 14:32
• 阅读 ( 835 )

单细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中

单细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-08-29 13:40
• 阅读 ( 828 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌（HNSCC）(GSE181919)

数据介绍： 来自谷歌翻译： 肝细胞癌（HCC）代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里，我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组：原发肿瘤、门...

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-10-31 14:05
• 阅读 ( 796 )

scanpy 中 ScTransform分析：

scanpy 中 ScTransform分析：

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-11-20 08:23
• 阅读 ( 747 )

单细胞分析绘制marker基因展示图时如何设置细胞排布顺序

基因展示图时如何设置细胞排布顺序

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-10-29 09:47
• 阅读 ( 706 )

非小细胞肺癌（GSE123904）

非小细胞肺癌（GSE123904）

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2024-08-16 14:54
• 阅读 ( 672 )

非模式物种10X空间转录组单细胞参考基因组构建

非模式物种10X空间转录组单细胞参考基因组构建

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2025-01-14 16:09
• 阅读 ( 471 )

inferCNV 测试

inferCNV 测试

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2025-01-10 11:26
• 阅读 ( 444 )

拟南芥叶单细胞分析流程

拟南芥单细胞分析流程

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2025-01-23 14:41
• 阅读 ( 421 )

超长染色体的转录组分析注意要点

不同物种进行转录组分析的时候流程大致相同，但是当我们做的物种有一个庞大的基因组，那么流程中有一些参数需要进行修改： 1. Markdup和SplitNTrim的时候不要生成bai的索引，主要是 Markdup的...

• 0
• 0
• Ti Amo
• 发布于 2025-02-20 14:42
• 阅读 ( 289 )

检查kegg的map是否能和差异基因对上

我们进行kegg富集分析之后，除了会得到差异基因和KO编号对应的KOlist信息，还会拿到kegg pathway map的信息，分为html和png的结果展示，大概是这样的结果： 一般来说我们最好检查一下，这里...

• 0
• 0
• Ti Amo
• 发布于 2025-02-24 16:07
• 阅读 ( 269 )

用AI写代码批量整理GEO数据库中的单细胞数据

用AI写代码只批量链接GEO 10X数据：

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2025-03-14 18:42
• 阅读 ( 186 )

《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架

《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架

• 0
• 0
• 安生水
• 发布于 2025-03-17 16:01
• 阅读 ( 141 )