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20个转录组基本知识点-你必须知道！

做转录组实验，发转录组文章，你不得不知道的20个基本知识点。

转录组测序分析数据库介绍

转录组数据分析常用数据库介绍

R语言对基因表达量数据RNA-seq做PCA分析

PCA(principal component analysis )主成分分析，可以分析样品之间相关性，确定样品总体上的差异，或者查看是否有批次效应等

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-04 15:21
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转录组扫盲系列--reads如何比对到参考基因组上？

上一期给大家介绍了转录组建库原理：转录组扫盲系列--转录组如何建库？建完库下一步就是测序，测序原理讲起来其实很复杂，但是我觉得测序过程少了解一点对于理解转录组数据影响不是很大，下面有...

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  • 红橙子
  • 发布于 2021-04-26 19:13
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5分钟看懂KEGG代谢通路图

ko、map等开头的代谢图有啥区别？里面的点、线、不同颜色都代表什么含义？看完这篇就懂啦！

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-20 21:41
  • 阅读 ( 24913 )

mapman非模式植物基因注释时遇到的问题

解决老牌植物软件mapman出图的bincode与图上的binname不匹配

转录组结果解读及分析技巧

已经测了转录组，或者计划做转录组，但又担心写不出来文章？一站式解决转录组难题，趁开学前投稿吧！

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  • omics007
  • 发布于 2020-05-18 14:01
  • 阅读 ( 15102 )

JASPAR网站预测启动区域有那些转录因子结合位点

JASPAR网站预测启动区域有那些转录因子结合位点

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-27 10:14
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转录因子研究方法！

转录因子研究方法

WGCNA分析要求

WGCNA常见问题

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-25 10:04
  • 阅读 ( 11633 )

转录组数据挖掘的几个建议

如何挖掘数据？明确研究目的，实验方案设计，关注已知的结果，结合表型，进行突破

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-18 11:28
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转录组扫盲系列--转录组如何建库？

很多老师都做过转录组，但你对转录组了解吗？知其然，更要知其所以然，才能对数据结果理解更深入，从本期起，小编给大家详细介绍下转录组实验及分析过程，里面肯定有你不知道的知识，赶紧get下...

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  • 红橙子
  • 发布于 2021-04-26 19:02
  • 阅读 ( 11450 )

转录组扫盲篇

转录组（transcriptome）广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA、非编码RNA以及小RNA等，不过咱们常说的转录组或者RNA-seq，一般是指狭义上的“转...

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  • 红橙子
  • 发布于 2019-03-20 14:34
  • 阅读 ( 6401 )

pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

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  • microRNA
  • 发布于 2018-08-03 10:54
  • 阅读 ( 19557 )

转录组测序样品间的相关性有何意义？如何计算?

样品间的相关性反应了样品间的相似程度，即不同处理或组织的样品在表达水平方面的相似度。相关系数越 接近1，样品间的相似度越高，样品间的差异基因也越少。生物学重复间的样品的相关系数...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-28 14:02
  • 阅读 ( 12642 )

WGCNA剔除异常样本

WGCNA剔除异常样本

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-25 10:53
  • 阅读 ( 6792 )

R包hdf5r安装失败 SeuratDisk 安装失败

R包hdf5r安装失败 SeuratDisk 安装失败

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-01-22 10:23
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什么是转录因子？

转录因子基本介绍

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-29 10:09
  • 阅读 ( 6040 )

转录组差异基因为什么要进行聚类分析？

       聚类分析用于判断差异基因在不同实验条件下的表达模式，将表达模式相同或相近的基因聚集成类，进而识别未知基因的功能或已知基因的未知功能，这些同类基因可能具有相似的功能，共同参...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-28 16:28
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如何将GEO芯片注释文件整理成GSEA能使用的芯片注释文件？

将GEO数据库中的注释文件整理成GSEA软件可以使用的芯片注释文件

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  • landy
  • 发布于 2018-06-22 15:01
  • 阅读 ( 8977 )