什么是GSEA?

GSEA的定义 Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分析)用来评估一个预先定义的基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势,从而判断其对表型的影响作用。其输入数据包含两部分...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-24 10:20
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如何绘制一份韦恩图

给大家介绍一类代表包含关系的图,那就是韦恩图。

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  • microRNA
  • 发布于 2018-04-21 22:39
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《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架

《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架

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  • 安生水
  • 发布于 2025-03-17 16:01
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用AI写代码批量整理GEO数据库中的单细胞数据

用AI写代码只批量链接GEO 10X数据:

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  • 发布于 2025-03-14 18:42
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检查kegg的map是否能和差异基因对上

我们进行kegg富集分析之后,除了会得到差异基因和KO编号对应的KOlist信息,还会拿到kegg pathway map的信息,分为html和png的结果展示,大概是这样的结果: 一般来说我们最好检查一下,这里...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-02-24 16:07
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超长染色体的转录组分析注意要点

不同物种进行转录组分析的时候流程大致相同,但是当我们做的物种有一个庞大的基因组,那么流程中有一些参数需要进行修改: 1. Markdup和SplitNTrim的时候不要生成bai的索引,主要是 Markdup的...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-02-20 14:42
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拟南芥叶单细胞分析流程

拟南芥单细胞分析流程

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  • 发布于 2025-01-23 14:41
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非模式物种10X空间转录组单细胞参考基因组构建

非模式物种10X空间转录组单细胞参考基因组构建

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  • 发布于 2025-01-14 16:09
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单细胞转录组镜像代码更新4.0

单细胞转录组镜像代码更新4.0

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  • 发布于 2025-01-13 11:48
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inferCNV 测试

inferCNV 测试

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  • 发布于 2025-01-10 11:26
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单细胞转录组-inferCNV拷贝数变异分析介绍

单细胞转录组-inferCNV拷贝数变异分析介绍

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  • 发布于 2025-01-10 10:52
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scanpy 中 ScTransform分析:

scanpy 中 ScTransform分析:

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  • 发布于 2024-11-20 08:23
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌(HNSCC)(GSE181919)

数据介绍: 来自谷歌翻译: 肝细胞癌(HCC)代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里,我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组:原发肿瘤、门...

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  • 发布于 2024-10-31 14:05
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单细胞分析绘制marker基因展示图时如何设置细胞排布顺序

基因展示图时如何设置细胞排布顺序

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  • 发布于 2024-10-29 09:47
  • 阅读 ( 706 )

Scanpy数据结构:AnnData

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  • 发布于 2024-10-11 15:42
  • 阅读 ( 1340 )

非负矩阵分解(cNMF)

非负矩阵分解(cNMF)

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  • 发布于 2024-09-24 18:11
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10X Visium空间转录组图像

10X Visium空间转录组图像

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  • 发布于 2024-09-19 13:20
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读 10X的空间转录组数据报错

读 10X的空间转录组数据报错

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  • 发布于 2024-09-18 16:58
  • 阅读 ( 860 )

单细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中

单细胞转录组如何将UCell CytoTRACE2 infercnv等结果添加到总的rds中

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  • 发布于 2024-08-29 13:40
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单细胞转录组-infer CNV拷贝数变异分析介绍

单细胞转录组-infer CNV拷贝数变异分析介绍

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  • 发布于 2024-08-26 17:20
  • 阅读 ( 1615 )