immune_compare_stat.r 免疫细胞表达差异比较

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heatmap_group_plot.r 分组热图展示免疫侵润结果

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merge_tsv_files.r 根据共有ID横向合并表格文件

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hclust_analysis.r 转录组数据层次聚类分析

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immune_bar_plot.r 免疫侵润分析bar绘图

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ssGSEA.r 单样本基因集富集分析

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immune_infiltrates_rnaseq.r RNA-seq 转录组数据免疫侵润分析

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exp_immu_cor_plot.r 基因表达量与免疫侵润相关性绘图分析

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  • 发布于 2021-06-15 14:33
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subset_row.r 提供列表,在行上取数据子集

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  • 发布于 2021-06-11 14:57
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subset_column.r 根据ID列表,取对应列的数据:

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  • 发布于 2021-06-11 14:44
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tcga_gene_exp_download.r TCGA数据下载脚本使用说明。

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ConsensusClusterPlus 包对基因表达数据进行一致性聚类

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TCGA 临床随访信息follow up 各列介绍:

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TCGA数据库介绍

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免疫疫微环境(TIME)

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癌症缺氧相关基因查找,以及样本分类方法 ,免疫微环境

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TCGA数据库相关分析工具网站

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Oncomine数据库介绍

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Cox与KM生存分析及结果解读

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用R语言进行KM生存分析

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