immune_compare_stat.r 免疫细胞表达差异比较
heatmap_group_plot.r 分组热图展示免疫侵润结果
merge_tsv_files.r 根据共有ID横向合并表格文件
hclust_analysis.r 转录组数据层次聚类分析
immune_bar_plot.r 免疫侵润分析bar绘图
ssGSEA.r 单样本基因集富集分析
immune_infiltrates_rnaseq.r RNA-seq 转录组数据免疫侵润分析
exp_immu_cor_plot.r 基因表达量与免疫侵润相关性绘图分析
subset_row.r 提供列表,在行上取数据子集
subset_column.r 根据ID列表,取对应列的数据子集
tcga_gene_exp_download.r 脚本帮助
ConsensusClusterPlus 包对基因表达数据进行一致性聚类
TCGA 临床随访信息follow up 各列介绍:
TCGA数据库介绍
免疫疫微环境(TIME)
癌症缺氧相关基因查找,以及样本分类方法
TCGA数据库相关分析工具网站
Oncomine数据库介绍
Cox与KM生存分析及结果解读,查找与预后相关的biomarker
用R语言进行KM生存分析