代谢组数据上传NGDC!简单又快捷!

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  • 安生水
  • 发布于 2024-01-30 17:59
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蛋白质组学数据定量搜库 | MaxQuant软件的使用

简介: MaxQuant是基于质谱(Ms)的蛋白质组学数据分析最常用的平台之一,免费使用,目前认可度相对较高,可针对多种质谱数据格式(.raw、.wiff、.mzML、.mzxml)。且内置了自己的肽段搜索引擎-...

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  • rzx
  • 发布于 2024-06-26 11:52
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转录组个性化分析之可变剪切分析工具:rMATS turbo

转录组个性化分析之可变剪切分析工具:rMATS turbo

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  • 安生水
  • 发布于 2024-04-01 11:36
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使用bcftools文件提取vcf文件子集

1. 准备好要提取的染色体及位置信息文件id.list。文件示例如下: Chr1    11787600        11793521Chr1    30028805        30042382Chr1    54966087        54970283Chr1    57228272     ...

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  • rzx
  • 发布于 2024-03-11 18:13
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BLINK(C版本) 进行 GWAS分析的教程

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  • 星莓
  • 发布于 2023-12-27 11:31
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cytoscape软件的安装与使用_v3.10.2

Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络,并依据基本的数据的结合成可视化网络。

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  • rzx
  • 发布于 2024-04-30 17:41
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Windows里MaxQuant下载与安装

MaxQuant网址:https://www.maxquant.org/

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  • rzx
  • 发布于 2024-06-19 17:02
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ProteoWizard工具的安装与使用

ProteoWizard 是一套用于蛋白质组学数据分析和转换的开源软件工具,它支持多种质谱数据格式转换、可以用于谱图查看、质谱仪器参数查看、还可以用于蛋白序列模拟酶切…… ProteoWizard官网:https...

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  • rzx
  • 发布于 2024-06-14 15:13
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序列的提取和截取

序列的提取是我们生物学分析的基础操作,在许多分析中都会使用到。在这里给大家提供几个提取序列的命令。

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-06-05 14:27
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LTR_HARVEST的并行软件LTR_HARVEST_parallel

在对基因组进行评估的时候,LAI是连贯性完整性的指标之一。目前经常使用的计算 LAI 的软件是 LTR_retriever,他并非是一个单一的工具,而是通过整合多个LTR预测软件的结果,过滤其中的假阳性LTR...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-04 14:29
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探索基因大数据的利器——SRA Explorer

探索基因大数据的利器——SRA Explorer

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-08 15:19
  • 阅读 ( 1937 )

windows安装Aspera Connect软件

windows安装Aspera Connect软件

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  • 安生水
  • 发布于 2024-03-22 17:29
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NCBI 基因组文件下载——datasets

datasets和dataformat是NCBI的命令行(Command line tools)工具,datasets可以下载ncbi上的生物数据,dataformat可以将metadata数据从json格式转化成其他格式类型。 1. 下载工具 curl -o d...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-04-24 16:52
  • 阅读 ( 1799 )

在Windows系统中安装并使用seqkit工具

seqkit软件介绍: Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件,由go语言编写,功能比较完善,软件使用也很稳定。 下载链接:https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式: 1. 点...

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  • rzx
  • 发布于 2024-03-19 17:01
  • 阅读 ( 1733 )

如何预测CpG岛

在人类基因组的广袤海洋中,隐藏着许多生物学上重要的结构,其中之一就是CpG岛。这些富含CpG二核苷酸的DNA序列区域在基因表达调控中扮演着关键角色。然而,要想有效地理解这些岛屿的功能,首先...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-06-04 14:44
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火山云 | tos:// 数据下载 | windows/linux下载方式

01:windows | 通过 共享链接 登录 TOS Browser 软件(版本> v1.7.0)下载 01-1:在本地电脑下载TOS Browser 软件,安装包网址:https://www.volcengine.com/docs/6349/148777 01-2:双击...

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  • rzx
  • 发布于 2024-08-01 11:34
  • 阅读 ( 1521 )

rMATS turbo使用

rMATS turbo使用

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  • 安生水
  • 发布于 2024-01-17 11:30
  • 阅读 ( 1476 )

SURVIVOR工具进行结构变异结果文件的格式转换(bedtovcf)

结构变异结果文件格式转换工具——SURVIVOR

使用fastp软件对fastq文件进行剪切

使用fastp软件对fastq文件进行剪切

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  • 安生水
  • 发布于 2024-02-22 17:33
  • 阅读 ( 1230 )