软件工具 - 热门的文章 - 第2页 - 组学大讲堂问答社区

vscode更新导致低版本系统无法登陆的问题

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xun
发布于 2024-02-02 14:24
阅读 ( 1137 )

甲基化水平如何计算

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安生水
发布于 2024-07-11 09:51
阅读 ( 1116 )

HISAT2比对时报错|(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL)

我有12个样本在进行HISAT2比对时有3个样本出现报错(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL) 运行脚本： hisat2 -p 10 --rg-id=L2 --rg SM:L2 --rg LB:L2 --rg PL:ILLUMINA -x iwgsc_re...

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rzx
发布于 2024-03-07 10:12
阅读 ( 1100 )

CLUMPAK安装

CLUMPAK这个软件很古老,安装起来也很麻烦,记录一下https://tau.evolseq.net/clumpak/download/CLUMPAK.zip 安装包下载路径解压以后添加库的位置到环境 export PERL5LIB=path/CLUMPAK:$PERL5LI...

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xun
发布于 2024-01-26 17:02
阅读 ( 1049 )

htop查看程序的io占用

传统的top大家都用的很多,但是top里不会显示磁盘io,而在我们服务器里,磁盘高io往往才是程序运行的瓶颈新版的htop新增了io 的查看,读写过高对应选项会变成红色,方便我们查看,除此之外htop还有...

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xun
发布于 2024-04-25 11:03
阅读 ( 1045 )

qsub任务投递系统的常用命令 SGE任务调度

qsub全称为”Queue Submitter”，是Sun Grid Engine (SGE)集群管理软件中的一个命令行工具。它的主要作用是将用户提交的任务加入到队列中，等待计算节点执行。qsub可在Unix/Linux等操作系统下使用...

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Ti Amo
发布于 2024-06-26 17:54
阅读 ( 1032 )

超快的文件传输软件trzsz

对于服务器而言,和本地的文件互相传输是家常便饭,scp虽然快速,但是毕竟要打很多字,有点麻烦,lrzsz十多年没跟新了,所以我推荐了这个软件trzsz用法和lrzsz差不多,也有额外的功能,有需要自己看帮助...

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xun
发布于 2024-01-09 10:56
阅读 ( 1019 )

GFF或GTF格式转bed

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安生水
发布于 2024-03-14 14:02
阅读 ( 1001 )

seqcluster软件安装

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安生水
发布于 2024-01-10 13:38
阅读 ( 989 )

GATK 4.4.0报错“ A JNI error has occurred, please check your installation and try again”

报错在利用GATK进行markdup和variant calling的时候出现报错：报错的主要信息用红框框出了，错误信息是：错误为发生JNI错误，请检查安装并重试。出现报错的原因： 1. javac与java版本...

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Ti Amo
发布于 2024-03-25 11:54
阅读 ( 924 )

lnd无法下载样本名称含有+的数据

linuxnd linuxnd是linux系统下载诺禾致源测序数据的软件，其基础功能如list、cp、cp -d 已经在这篇文章中给大家列出： https://www.omicsclass.com/article/2084 错误的产生该软件在遇到...

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Ti Amo
发布于 2024-01-31 10:52
阅读 ( 919 )

bowtie2 将fasta序列比对到参考基因组

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安生水
发布于 2024-08-16 10:26
阅读 ( 862 )

BaiduPCS-Go上传经常出错

使用BaiduPCS-Go上传文件经常出现错误,检查一下版本直接使用软件自带的不一定下载成功 ,所以手动下载一下,这个版本直接解压就行,有需要的可以下一下,不需要编译了, BaiduPCS-Go-v3.9.5-li...

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xun
发布于 2024-01-02 15:54
阅读 ( 858 )

bcftools创建vcf索引失败

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安生水
发布于 2024-03-18 13:44
阅读 ( 721 )

VScode文档列对齐插件-code alignment

一款VScode中文档列对齐的插件

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每天学习一点点
发布于 2024-05-29 11:56
阅读 ( 693 )

gtfToGenePred报错

使用gtfToGenePred的命令和报错： gtfToGenePred -genePredExt Drosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf refFlat.tmp.txtDrosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf (GFF not supported by t...