circos改变某两条染色体之间的距离

circos改变某两条染色体之间的距离

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  • 安生水
  • 发布于 2024-09-23 15:15
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pfamscan程序-translate和python的translate冲突问题

pfamscan程序-translate和python的translate冲突

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-08-27 16:44
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SRA Toolkit 工具首次使用提示“This sra toolkit installation has not been configured”

SRA Toolkit 是一套由 NCBI (National Center for Biotechnology Information) 开发的软件工具,用于从 SRA (Sequence Read Archive) 数据库下载和处理生物序列数据。

ifconfig不显示ip

如题,在ifconfig的时候如果没有出现IP地址,同时确保自己网络连接没问题 nmcli con show NAME  UUID                                  TYPE      DEVICE  eno1  1377a295-708b-4cb4-a1cb-0...

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  • xun
  • 发布于 2024-10-10 15:57
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perl报错:symbol lookup error: xxxxx: undefined symbol: Perl_xs_handshake

glimmhmm是一个基因从头预测的软件,他的运行需要先训练模型再预测基因 报错: 运行trainGlimmerHMM的时候出现报错”undefined symbol: Perl_xs_handshake“ 问题: per调用的lib里面没有相关...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-10-22 13:55
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HiC-Pro 报错检索解决

报错: 运行HiC-Pro的时候出现报错: 去看log文件发现: 只能知道是在比对的step1就出现了问题。 问题查找: 此时我们需要去HiC-Pro的scripts文件夹下面去查看Makefile这个文件,看一...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-10-28 15:12
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eQTL分析之协变量计算

准备eQTL分析的协变量文件

seqkit | 对fa序列文件中序列长度进行筛选

seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除

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  • rzx
  • 发布于 2024-11-19 19:01
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annovar的染色体识别问题

如果是非数字形式的染色体编号(尤其是其中有特殊字符),annovar的注释可能会有问题,需要改成数字格式

linux 编码转换

在linux里面编辑二进制文件有以下两种方法: 1. vim 打开二进制文件: vim -b 文件 将内容转换成16进制: :%!xxd 转换回来: :%!xxd -r  2. iconv  # 将UTF-8编码的wx.txt文件转换为GB...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-12-03 14:56
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hisat2-build报错:Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)

hisat2-build报错:Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)

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  • 安生水
  • 发布于 2024-12-11 15:15
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Trinity报错“Error, not recognizing read name formatting”

在使用trinity做de novo的时候,发现软件报错了