kpsewhich命令缺失导致jcvi运行报错
Adobe Illustrator 无法加载次应用程序的本地化资源文件 可以通过右键选择“管理员身份运行” 后能正常使用
GEOdataset
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MEME参数使用说明使用说明
腾讯云服务器获取指南
多基因组基因水平共线性分析
blast 结果说明
用blastall进行序列比对,详细参数说明
bedtools求交集 其用法: bedtools intersect [OPTIONS] [-a|-abam]-b BED 输入文件是bed格式,至少三列,分别...
蛋白质分析,经常要分析蛋白质的保守结构域,通常要展示多序列比对结果才能说明不同序列间的保守性;看到别人分析的蛋白保守结构域都有一个漂亮的多序列比对结果;今天我们就来介绍绘制这种氨基酸比对图:
多基因间共线性及局部基因水平的共线性
eclipse下搭建shell脚本编辑器--安装开发shell的eclipse插件shelled
有时候,常用的基因组收录数据库网站上没有收录我们要研究的物种的基因组,比如ensembl,JGI上都没有,这时候我们可以考虑一下NCBI上收录的基因组;但是NCBI上收录的不常见的物种注释信息往往不是很完整,而且基因和染色体编号都会重新命名,用起来很麻烦;所以除非迫不得已,一般不建议从NCBI上下载参考基因组;
mcsan结果文件说明
三个基因组共线性分析
hmmsearch寻找相似序列
使用fastp软件对fastq文件进行剪切
Bowtie2使用方法与参数介绍