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blast报错

在刚开始按官网教程（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279680/）学习使用blast时，经常会遇到程序报错

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 15:00
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BLAST+使用方法

BLAST+是使用非常广泛的序列比对软件，有NCBI提供

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:36
  • 阅读 ( 6711 )

dcaps标记设计软件——SNP_Primer_Pipeline

之前在做dcaps标记，开始只找到网站版的软件，后来发现一个不错的脚本软件——SNP_Primer_Pipeline

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:21
  • 阅读 ( 6210 )

小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具

文章投稿，除了文好当然还要“颜好”！在这个看脸的世界，为了给文章加分，各位老师学生也是做足功课了！但是不会编程敲代码？——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-06 09:07
  • 阅读 ( 13735 )

DNA SequenceLogo

快速绘制DNA Logo

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-05 22:39
  • 阅读 ( 3724 )

你了解SAM和BAM文件吗

当我们测序得到的fastq文件map到基因组之后，会得到一个以SAM或Bam为扩展名的文件。这里将详细介绍SAM和Bam文件！

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 09:33
  • 阅读 ( 11955 )

endnote 插入文献 变成临时 大括号{} 不自动更新文献

endnote 文献插入出现大括号，不自动更新解决办法

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-27 17:53
  • 阅读 ( 33766 )

搭建生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）

搭建自己的生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-25 15:45
  • 阅读 ( 5122 )

MEGA构建进化树遇到报错信息

最近又有人遇到mega构建进化树时报错，所以分享一下这个经验给大家。 Oops!MEGA has encountered an error and cannot continue with this analysis:Some pairwise distances could not be estimated.For example,between sequences 23 and 11.

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-22 14:21
  • 阅读 ( 36595 )

endnote 如何插入书籍引用

endnote引用书籍的章节。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-22 13:43
  • 阅读 ( 34455 )

GEO数据芯片数据挖掘-在线工具分析GDS数据

自己没有数据，或者科研经费较少或者紧张，科研实验还要继续，利用GEO数据库筛选分子再做后续分析不失为一种经济而又快速的方法。本文详细讲解如何利用GEO数据库在线工具分析差异基因筛选全过程。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-21 17:31
  • 阅读 ( 8889 )

GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析

GEO2R是GEO在线分析工具，基于此工具可以对部分GEO样品数据进行基因差异表达分析。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-21 17:19
  • 阅读 ( 37277 )

Excel数据分析技巧之方差分析

做方差分析，用Excel，简单、快捷、方便，你值得拥有！

Excel数据分析技巧之双因素方差分析

>>方差分析之双因素方差分析 小编在节前做过一期使用excel表进行单因素方差分析的推送，反响不错，小编也颇受鼓舞！但是，在许多情况下，单因素方差分析已经不能满足实际分析的需要。比...

如何按照影响因子筛选文章--PubMed文献搜索技巧

PubMed文献搜索的一个实用技能--如何按照影响因子进行筛选文章？

GSEA分析需要的文件及格式

在作芯片数据或者是转录组数据的GSEA分析时候，需要四个文件： 1、基因表达数据文件； 2、表型数据文件； 3、功能基因集文件； 4、芯片注释文件； 这四个文件只需要分析者提供前两个文件即...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-14 15:11
  • 阅读 ( 21873 )

绘制基因结构图软件GSDS使用过程中图片的修改问题

在使用GSSE绘制基因结构或者是顺势作用元件时，如果图例太多，在网页展示不出来，这个时候你需要对图片进行修改.增大背景画布就可以显示了，点击下图红色箭头所指按钮，进入到图片编辑界面: 拉...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-14 14:48
  • 阅读 ( 11423 )

一个预测基因保守结构域网站

今天跟大家分享一个分析蛋白保守结构域的的网站： 网址：http://www.ebi.ac.uk/interpro/ 在上图的方框导入蛋白序列，点击submit，就开始运行，结果如下图所示： 这个网站不仅分析了蛋白的保...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-08 18:06
  • 阅读 ( 14640 )

pubmed按影响因子分类文献

pubmed按影响因子归类搜索文献

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-20 10:06
  • 阅读 ( 4553 )

提取bam/sam文件指定区域reads

若想要从sam或bam文件中提取指定区域内的reads，可以使用samtools和bedtools来实现。  首先准备一个区域信息文件。region.bed #第一列为染色体ID，第二三列分别为起始终止位置               ...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 09:34
  • 阅读 ( 14298 )