motif分析及meme的各项参数
fasta序列多行变单行
使用orthomcl分析同源基因时的 mysql数据库操作
win11安装docker
筛选出能比对到参考序列的reads,形成新的fastq文件
GenomicsDBImport 的多样本变异检测
ERROR 1290 (HY000): The MySQL server is running with the --skip-grant-tables 解决方法
pfam数据库被合并之后,还有很多数据库可以进行结构域的查询
想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据,看了一些下载教程,方法各异,看完思路还是不清晰,以下记录我的操作步骤,仅供参考
出现报错WARNING: Running pip as the 'root' user can result in broken permissions and conflicting behaviour with the system package manager. It is recommended to use a virtual envir...
MySQL报错:ERROR 2002 (HY000)
interpro 查询结构域
uniref50 数据库下载及格式化
比如在singularity中运行: singularity exec /share/singularity_images/reseq_v1.2.sif fastqc $datadir/*.gz -o $workdir/1.fastqc 可能报错: 可以加一个-t选项,多线程运行,如下图,...
Pheatmap绘制多分组热图
seqkit是一个序列处理神器,有统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等功能。 seqkit 一共有37个可用的命令,详细内容如下
组学大讲堂云共享服务器上线!
duplicate_gene_classifier属于MCScanX的核心程序,用于基因分类,统计全基因组不同类型复制事件的数目。 命令行格式: $duplicate_gene_classifier Dl Dl是物种缩写,是Dl.blast文件。在运...
hmmer之hmmbuild用法