GetOrganelle软件是一款由郁文斌老师开发的一套全新的细胞器基因组组装工具,可以对大规模的细胞器基因组进行快速、准确及自动化组装。
Rocky 9下Rstudio-service配置教程
HMMER ——hmmsearch 用法,参数
GATK4
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HMMER 隐马尔可夫模型序列最新下载方法
notepad++显示所有字符(隐藏的回车换行空格)转换CRLF
绘制进化树,是科研人的基础技能之一,而一张好看的进化树图,不仅能直观得展现基因或物种间的发育进化关系,更能增加文章的观赏性,赢得审稿人的青睐。今天给大家介绍的是一款非常实用且操作简...
branch-site models 类似于branch model和site model的合集,主要假设基因的不同位点间(site)和系统发育树的不同分支间(branch)的ω值均是变化的,目的是检验前景枝中正选择作用对部分位点的...
codeml是PAML软件包下的一个程序,在估算蛋白编码序列同义替换和非同义替换速率以及检测序列是否经受正选择分析中受到广泛应用。 对于一棵系统发育进化树,在考虑其不同序列间(site)和不同支...
braker
使用hisat2软件将测序数据比对到基因组
Clustal Omega是欧洲生物信息研究所(EBI)开发的多序列比对排列工具,现已经完全取代了之前ClustalW的地位。最新本的omega比对准确度更高,而且速度更快,适合大规模的多序列比对。
BUSCO评估基因组组装和完整性详解
circos绘圈图时更改字体
在进行iTOL绘制进化树时,需要导入分组圆环或者节点标签的配置文件。最后选择了单个文件上传,在调整好上一圈标签的位置后再导入下一个文件,这样就不会相互影响了。
解决办法如下 Microsoft Defender Smartscreen 关掉即可下载 接下来是安装 如果遇到Microsoft Defender SmartScreen 阻止了无法识别的应用启动。运行此应用可能会导致你的电脑存在风险。...
docker作为一个虚拟化工具,可以让我们直接使用镜像里面的生信分析软件分析我们的数据,省去安装linux软件的麻烦,对于初学linux的学员非常有用。 我们的《Docker生物信息工具安装与使用》课程...
KEGG富集分析弦图绘制
Uniprot数据库是资源最广、信息最丰富的蛋白质数据库,是查询蛋白功能的首选数据库。Uniprot数据库由Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD三大子数据库构成,数据主要来自于各物种基因组测序完成后得到...