进化树美化操作详解- iTOL

绘制进化树，是科研人的基础技能之一，而一张好看的进化树图，不仅能直观得展现基因或物种间的发育进化关系，更能增加文章的观赏性，赢得审稿人的青睐。今天给大家介绍的是一款非常实用且操作简...

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• rzx
• 发布于 2022-10-12 15:53
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送你一个小巧好用的序列分析软件-APE-功能强大，操作简单！

APE是一款序列分析软件，可以对序列进行酶切位点预测、序列比对、引物设计、DNA序列翻译等等，用途是十分广泛，APE软件小巧快速，操作简单，下面我们一起了解一下它的功能！ 1. 酶切位点预测...

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• 红橙子
• 发布于 2020-06-29 11:58
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Win10家庭版也可以装Docker桌面版了！

win10家庭版系统装docker桌面版的方法。

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• 生信老顽童
• 发布于 2020-04-28 08:32
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如何利用HMMER鉴定基因家族成员

作者 smyang2018 在可视化, 归档, 生物信息学, 软件学习 通常我们用的都是通过blast比对来确定我们需要的家族成员，首先是比对序列，再次是需要目标物种的蛋白序列，来进行比对，通常比对的时...

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• smyang2018
• 发布于 2019-04-04 10:23
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GeneDoc绘制漂亮的多重序列比对图

由于软件的功能限制，一些比对软件生成的比对文件，如Clustalx的*.aln文件，可读性差，无法满足高质量期刊的要求。因此，在实际操作过程中，需要对一些多重序列比对的文件进行着色美化。 GeneD...

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• 安生水
• 发布于 2019-03-01 12:00
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blast比对结果说明

我们作比对时经常用到blast，其比对结果一般都用m8格式（即参数是 -m 8，blast+是 -outfmt 6），但是结果文件中是没有表头的，这里来写一下。

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• 安生水
• 发布于 2018-07-20 11:13
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你了解SAM和BAM文件吗

当我们测序得到的fastq文件map到基因组之后，会得到一个以SAM或Bam为扩展名的文件。这里将详细介绍SAM和Bam文件！

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• 安生水
• 发布于 2018-06-29 09:33
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如何按照影响因子筛选文章--PubMed文献搜索技巧

PubMed文献搜索的一个实用技能--如何按照影响因子进行筛选文章？

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• 生信老顽童
• 发布于 2018-06-20 10:18
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利用NCBI和Pfam数据库查找基因家族保守结构域相关信息

相近功能基因的检索方法，如何利用pfam数据库下载隐马尔科夫hmm文件。

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• landy
• 发布于 2018-04-23 14:05
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ensembl和NCBI基因组下载，基因序列下载查看

参考基因组下载，Ensembl，NCBI，JGI等网站下载使用，可视化浏览,基因查看与下载等；

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• omicsgene
• 发布于 2018-04-22 14:59
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PASA报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc

通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释，其中PASA是转录组注释的常用软件。 报错： 把三代转录组数据投入PASA是出现报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, as...

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• Ti Amo
• 发布于 2024-09-30 13:50
• 阅读 ( 479 )

fastqc质控报告查看

fastqc质控报告查看

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• omicsgene
• 发布于 2020-04-15 15:31
• 阅读 ( 10578 )

如何使用NCBI进行blast比对

NCBI的blast功能你了解多少？

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• 生信老顽童
• 发布于 2020-03-20 16:26
• 阅读 ( 39407 )

ANNOVAR注释变异VCF结果说明

人类常见变异信息注释数据库结果

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• omicsgene
• 发布于 2019-04-29 16:19
• 阅读 ( 14696 )

FigTree进化树批量修改ID

FigTree批量修改ID

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• Daitoue
• 发布于 2019-01-17 09:41
• 阅读 ( 13217 )

iTOL修改进化树的标签基因ID名称

iTOL如何修改标签

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• 安生水
• 发布于 2018-12-07 10:32
• 阅读 ( 15922 )

Adobe Illustrator 无法加载次应用程序的本地化资源文件

Adobe Illustrator 无法加载次应用程序的本地化资源文件 可以通过右键选择“管理员身份运行” 后能正常使用

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• Daitoue
• 发布于 2018-10-29 09:27
• 阅读 ( 7897 )

blastall 搜索比对输出结果 m8或者m9格式说明（blast+ m6格式）

blast 结果说明

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• omicsgene
• 发布于 2018-10-19 12:06
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bedtools求交集

bedtools求交集 其用法： bedtools intersect [OPTIONS] [-a|-abam]-b BED 输入文件是bed格式，至少三列，分别...

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• 安生水
• 发布于 2018-10-19 11:30
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iTOL绘制好看的系统发育树

系统发育树也称为系统发生树、聚类树或者进化树。它以树状结构表示各个节点的进化和亲缘关系，枝点可以是物种和基因等，在系统发育分析、基因家族和物种进化分析中经常会看到此类图片。

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• 安生水
• 发布于 2018-09-07 14:26
• 阅读 ( 26070 )