bedtools求交集 其用法: bedtools intersect [OPTIONS] [-a|-abam]-b BED 输入文件是bed格式,至少三列,分别...
多基因间共线性及局部基因水平的共线性
系统发育树也称为系统发生树、聚类树或者进化树。它以树状结构表示各个节点的进化和亲缘关系,枝点可以是物种和基因等,在系统发育分析、基因家族和物种进化分析中经常会看到此类图片。
韦恩图又称文氏图,是科研文章中最常见的图,可以用来表示多个数据集之间的大致关系。小编来介绍几种常用在线绘制韦恩图的工具,简单易学!
手把手教你多个基因组共线性作图。
最近又有人遇到mega构建进化树时报错,所以分享一下这个经验给大家。 Oops!MEGA has encountered an error and cannot continue with this analysis:Some pairwise distances could not be estimated.For example,between sequences 23 and 11.
endnote引用书籍的章节。
今天有学员问 MCScanX 安装问题,我试了下,果然有错误。 make报错: g++ struct.cc mcscan.cc read_data.cc out_utils.cc dagchainer.cc msa.cc permutation.cc -o MCScanX msa.cc: In fun...
分享endnote文献管理工具
pfam打开不了解决办法,Pfam这个主页里,这些搜索项目点击没有反应,是咋回事呢
使用FigTree制作漂亮的系统发育树。这款软件需要在JAVA环境下运行,所以使用前记得要安装JAVA。 第一步:选择合适的树形 使用File – open 打开树文件(一般为.nwk文件),在左上方绿色...
PubMed 按影响因子过滤文献
简单高效的查找外源基因插入位置的方法,并可以设计共显性标记,方便后续实验验证。
MaxQuant网址:https://www.maxquant.org/
Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络,并依据基本的数据的结合成可视化网络。
seqkit软件介绍: Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件,由go语言编写,功能比较完善,软件使用也很稳定。 下载链接:https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式: 1. 点...
cytoscape安装报错:No JVM could be found on your system,通常是由于不适配的java版本
在前一篇文章里写了使用OthroFinder软件构建物种同源基因分析的工作原理的介绍,这次就利用Orthofinder结果中的数据来绘制物种系统发育树(Phylogenetic tree)。 在Orthofinder结果文件中有一...
minimap2是生信大牛Heng Li在2018年发表的三代序列比对工具。与传统的bwa相比,Minimap2可以用于三代测序, 也支持 splicing awared 比对;与一些传统三代比对工具相比,Minimap2 速度非常快,...
linux使用ossutil下载阿里云数据